より多くの試料を分析し、信頼性の高いデータを得るための、実験手順のシステム化をした。DNA抽出は従来の方法より単純化、小規模化することにより、短時間でより多くの試料を処理できるよう改良した。また、UV照射がDNA鎖を破壊する性質を利用した、コンタミネーション除去の方法を随所に採用した。

　タイ・マレー半島中央部のSakai洞窟出土の新石器時代の4個体およびMoh Khiew洞窟出土の後期旧石器時代の1個体の歯根部からDNAを抽出し、試みた検体すべてでPCR法による増幅に成功した。これらはいずれもアジアにおける最古の古人骨DNA分析の成功例である。古代人の分析にくわえ、現在マレー半島中央部にすんでいるMalayを6個体、マレー半島の先住民であるSenoiを12個体分析した。ミトコンドリアDNAの塩基配列をもちい近隣結合法で系統樹を構築したところ、新石器時代の個体は現存のSenoiに対し比較的高い親和性を示した。マレー半島の考古学的知見および言語学的知見と、今回の古代人および現代人の分析結果は矛盾しないものであった。

図1

　北部九州・詫田西分貝塚遺跡は弥生時代遺跡で、二つの埋葬様式、甕棺と土壙墓から人骨が出土した点で特徴的である。出土した112個体の人骨のうち37個体は甕棺から、75個体は土壙墓から出土した。このうち35個体(甕棺9個体、土壙暮26個体)についてDNA分析をおこなったところ、26個体(甕棺9個体、土壙墓17個体)のミトコンドリアDNA増幅に成功した。26個体から11配列がみつかり、これらの塩基配列から最大節約法で系統樹を構築した(図1;円の大きさは各配列の頻度に比例している。Kは甕棺、Dは土壙暮を示す)。矢印でしめしたcircldeAに甕棺出土人骨が集中している。反対に土壙墓出土人骨はcircleA以外の配列に分散している。この分布の偏りが偶然であるか否かをFisherの直接確率計算法で検定したところ、5%水準で有意差があると判定された。この結果から、二つの可能性がしめされた。もし二つの埋葬様式が同時代に存在した場合、死者を埋葬する際、遺伝的関係が考慮されていた可能性がある。一方、二つの埋葬様式がことなる時代に存在した場合、ことなる文化と遺伝的構成をもった人々がある特定の時代、この遺跡に流入した可能性がある。

　中国・山東省Linzi遣跡から出土した、約2,000年前の人骨42個体のDNA分析をおこなった。その結果、24個体のミトコンドリアDNA増幅に成功した。そして塩基配列を決定し、塩基多様度を算出したところ現代の東アジア5集団(台湾中国人、韓国人、本土日本人、アイヌ、沖縄人)とほぼ同程度の多様性をしめした。そこで世界中の人類集団のうちどの集団とLinziの人々は遺伝子頻度などにおいて共通性を示すかを探るために、日本DNAデータバンク(DDBJ)に登録されている世界中のさまざまな人類集団の塩基配列データの収集をおこなった。インターネットを介し、集めた2,000を越えるヒトのミトコンドリアDNAのデータのうち、ヨーロッパ、アフリカを除く人類集団のデータは、中東、東ユーラシア、アメリカ大陸あわせて約700個体分あった。MT1₊4と名付けた185bpの配列を比較した結果、これらのうち340配列は互いにことなる配列であった。この340配列から系統ネットワーク(最大節約法による系統樹に似た一種のグラフ)を構築した。この巨大ネットワークにはStar-like cluster(一つの配列を中心として星状に枝が伸びる形のクラスター)が20個みとめられた。このような星状の中心となる配列は過去における人口の爆発的増加の中心であった可能性が指摘されており(Sheny et al.,1994)、ヨーロッパではこのような星状の中心となる配列の一つをきわめて多くの個体が共有していることが報告されている(Richards et al.,1996)。今回構築した巨大ネットワークから、中東、東ユーラシア、アメリカ大陸でも少なくとも20配列を中心とする人口爆発があったことが予想される。また、この人口爆発の時期が先行の研究の推定値などをもとに概算された。そのうちの一つ、本州日本人と韓国人を最も多く含む配列の人口爆発の時期は3万年〜1万年以上前と推定された。次にStar-like clusterの中心から6個のグループ(A、A’、B、C、D、E)に分割し、それぞれのグループに各人類集団(地理的集団、民族的集団、ことなる時代の集団)がどのような頻度で分布しているかを調べた。その結果、本州日本人、韓国人、アイヌ、沖縄人は比較的似た頻度パターンをしめす一方、モンゴル人、アメリカ先住民、東南アジアおよび太平洋の人々、トルコ人はそれぞれ特徴ある頻度パターンをしめした。台湾中国人は全体としては他の東アジアの集団(本州日本人、韓国人、アイヌ、沖縄人)およびモンゴル人、アメリカ先住民)と似ていたが、グループEが比較的高い頻度を示すという点でそれらと異なっていた。そして、今回分析した約2,000年前の山東省のLinzi遺跡から出土した集団は、現代台湾中国人(漢民族)と最も似た頻度パターンをしめすことが判明した。これらの分析結果は現代日本人の形成に関して、次のような示唆を与えた。すなわち、1)現代日本人の大半が約3万年〜1万年以上前に起こった、人口の爆発の結果、朝鮮半島および日本列島に形成された集団である。また、2)約2,000年前の山東半島における遺伝子頻度パターンは現在の台湾中国人にみられる遺伝子頻度パターンと似ていたことから、約2,000年前にはすでに現代台湾中国人(漢民族)にみられる遺伝的構成が形成されていたと考えられる。さらに、このパターンは現代本州日本人とも弥生時代人ともことなっていた。したがって、もし弥生時代の大陸からの渡来民の原郷が山東半島と考えた場合、渡来民の遺伝子流入が現代日本人の遺伝的構成に大きな影響は与えた可能性は低いとおもわれる。また渡来民の原郷が朝鮮半島と考えた場合、渡来民と在来民の間に遺伝的差はほとんどなかったであろう。3)第4章にしめしたように、埋葬文化と遺伝的背景の関連性をしめす結果を考慮しても、弥生時代に渡来があったことは事実と考えられる。また、細部において本州日本人、韓国人と、アイヌ、沖縄人の間には頻度パターンの差があったことから、日本列島人類集団に二重構造が存在するのは事実と思われるがこれは埴原(1991)の提唱した二重構造とは別のものである。